你的冠军之旅始于真新镇家中的二楼，在动身前往楼下前，记得先检查房间内的电脑，里面有一份免费的伤药可以拿走。之后离开家，向左上方的草丛走去，大木博士会出现并将你带往他的研究所。在那里，你将遇到你此行的主要对手小茂，并在大木博士的介绍后选择你的初始搭档：妙蛙种子、杰尼龟或小火龙。选择完毕后，小茂会立即向你发起挑战，他使用的宝可梦属性会克制你的选择。战胜他你便可以正式踏上旅程。离开真新镇向北走，抵达常磐市，进入商店从店员那里拿到大木博士的包裹，将它送回博士的研究所，作为回报，你会获得至关重要的宝可梦图鉴，这是记录你冒险成果的基石。
拿到图鉴后，你的冒险才算真正展开。从常磐市左侧的22号道路前行会再次遇到小茂并进行一场对战，获胜后继续前进，一位老爷爷会教你如何捕捉宝可梦。接着穿过2号道路进入常磐森林，这里栖息着皮卡丘等宝可梦，穿过森林后便抵达第一个道馆所在地尼比市。挑战并击败岩石系馆主小刚，获得灰色徽章，这不仅证明了你的实力，也允许你在野外驱使更高等级的宝可梦。你需要经过月见山，那里有火箭队活动，并在深处获得一块古代化石。走出月见山来到华蓝市，击败水系馆主小霞，获取蓝色徽章。沿途，你会从不同人物那里获得关键的秘传技能，例如居合斩用于砍断小树开路，闪光术用于照亮黑暗的洞穴，这些都是推进剧情不可或缺的能力。
冒险深入，你将陆续挑战剩余的道馆，收集全部八枚徽章。这个过程遍布关都地区，涉及解决火箭队的阴谋、搭乘圣安奴号游轮、探索宝可梦塔等一系列事件。每击败一位馆主，你的指挥权限和宝可梦能力都会得到提升，同时也会获得各种技能机器来丰富战术。当八枚徽章集齐，通往联盟的最后屏障——冠军之路便会为你敞开。冠军之路是一个复杂的大型迷宫，不仅是实力的试炼，更是解谜能力的考验。你需要熟练运用怪力术来推动岩石，将其精准地嵌入地面的白色机关以消除障碍墙壁；在黑暗区域必须依赖闪光术照明；部分岩层需要碎岩术开路，而底层的水道则必须掌握攀瀑术才能跨越。迷宫内遍布等级超过50级的强大训练师，需要你谨慎应对。
成功穿越冠军之路后，你就到达了宝可梦联盟所在地。最终的挑战是连续对阵四位强大的天王以及现任冠军。在此之前，确保你的宝可梦队伍已经过充分的训练和合理的搭配，队伍的整体强度和属性平衡至关重要，面对不同属性的天王需要有相应的克制策略。这场终极车轮战没有中途恢复的机会，考验的是你长期以来培养的阵容深度、资源管理能力和临场指挥。战胜最后的冠军，你的名字将被刻入荣誉殿堂，这意味着你在口袋妖怪火红版的冒险中达到了最高成就，赢得了冠军的荣誉。
